Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsu1Q01730 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms