Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2cQ01098 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin2cQ01098 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms