Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Grin2bQ01097 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms