Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp1Q00915 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms