Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VegfaQ00731 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VegfaQ00731 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms