Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKL1Q00532 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKL1Q00532 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms