Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp10Q000W5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms