Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama4P97927 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama4P97927 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama4P97927 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms