Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AlkP97793 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlkP97793 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlkP97793 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlkP97793 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlkP97793 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlkP97793 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlkP97793 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlkP97793 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlkP97793 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlkP97793 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlkP97793 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms