Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ext1P97464 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ext1P97464 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ext1P97464 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms