Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp1P97350 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp1P97350 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp1P97350 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp1P97350 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp1P97350 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pkp1P97350 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms