Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx2P80206 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms