Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shox2P70390 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Shox2P70390 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shox2P70390 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms