Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp7P70280 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms