Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnab1P63143 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnab1P63143 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms