Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbdP63072 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbdP63072 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbdP63072 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbdP63072 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbdP63072 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbdP63072 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms