Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3cP62823 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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