Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm6P62313 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms