Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan5P62080 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan5P62080 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms