Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tdrd6P61407 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd6P61407 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms