Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psme3P61290 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms