Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2iP60898 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms