Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3eP60229 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3eP60229 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms