Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup43P59235 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms