Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33bP59016 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33bP59016 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms