Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms