Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fdft1P53798 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms