Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RabggtbP53612 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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