Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fgd1P52734 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgd1P52734 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms