Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp1P52624 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms