Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RoraP51448 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RoraP51448 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RoraP51448 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RoraP51448 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RoraP51448 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms