Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnt2P50752 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt2P50752 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms