Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epb42P49222 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms