Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CitP49025 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CitP49025 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CitP49025 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CitP49025 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CitP49025 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CitP49025 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CitP49025 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CitP49025 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CitP49025 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CitP49025 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms