Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx3P48759 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms