Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf1P46099 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf1P46099 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms