Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PtgfrP43117 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtgfrP43117 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtgfrP43117 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtgfrP43117 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtgfrP43117 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtgfrP43117 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms