Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-2P42586 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms