Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf9P41274 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf9P41274 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms