Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd1P40201 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd1P40201 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chd1P40201 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms