Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cap1P40124 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cap1P40124 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cap1P40124 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cap1P40124 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cap1P40124 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cap1P40124 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cap1P40124 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cap1P40124 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms