Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik2P39087 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grik2P39087 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms