Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms