Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd40lgP27548 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd40lgP27548 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms