Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CftrP26361 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CftrP26361 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CftrP26361 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CftrP26361 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CftrP26361 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CftrP26361 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CftrP26361 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CftrP26361 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CftrP26361 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CftrP26361 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CftrP26361 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms