Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd12P23812 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd12P23812 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms