Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsta3P23591 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsta3P23591 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms