Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eif3aP23116 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3aP23116 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms