Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RargP18911 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RargP18911 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RargP18911 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RargP18911 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RargP18911 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RargP18911 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RargP18911 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RargP18911 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RargP18911 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms