Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtpraP18052 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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